Det finns enligt mig oändligt mycket att se och göra i Berlin men motorrelaterat kan jag bara komma på Meilenwerk Classic remise:
http://www.remise.de/
Ett måste för den bilintresserade och det brukar även finnas några få äldre motorcyklar. Det är inget typiskt museum utan en stor lokal där folk förvarar sina fina bilar och det finns även verkstäder i lokalen där man kan kika in (men ej gå in) medans de håller på jobbar med bilarna.
Det är gratis att gå in dessutom.
Adressen är Wiebestrasse 36-37. Ta S-bahn till Beusselstrasse och promenera ca 10min.
Tillägg:
Deutsche teknikmuseum är ett suveränt (och stort!) tekniskt museum som har en del fordon, framförallt mycket lokomotiv men även bilar, båtar och flygplan.
http://www.sdtb.de/Dauerausstellungen.80.0.html
U-bahn till Gleisdreieck sen är det runt hörnet.